Epistemologi Ilmu Pendidikan Islam merupakan Jilid 2 dari trilogi epistemologi pendidikan Islam yang berfokus pada bagaimana pendidikan Islam dibangun sebagai sebuah disiplin ilmu yang memiliki identitas, objek kajian, sumber teori, paradigma, metodologi, dan kriteria validitas. Buku ini berangkat dari persoalan identitas ilmu pendidikan Islam, kemudian membahas struktur keilmuan, paradigma, pembentukan teori, serta hubungan antara sumber normatif, pengalaman empiris, konsep, dan teori dalam membangun pengetahuan pendidikan Islam yang dapat dipertanggungjawabkan secara akademik.
Pembahasan selanjutnya diarahkan pada metodologi ilmu pendidikan Islam, penelitian, validitas pengetahuan dan teori, relasi interdisipliner, serta rekonstruksi dan masa depan disiplin. Buku ini menempatkan metodologi bukan sekadar sebagai teknik pengumpulan data, melainkan sebagai hubungan antara asumsi tentang realitas, sumber pengetahuan, pertanyaan penelitian, argumentasi, validitas, dan tanggung jawab etis. Pada bagian akhir, buku mengajak pembaca melihat kebutuhan rekonstruksi ilmu pendidikan Islam agar mampu merespons perubahan zaman tanpa kehilangan orientasi nilai dan identitas keilmuannya.